（一）涉台政治
1. 张遂新 等：《“因政”与“因俗”：“一国两制”的类型学分析》，《台湾研究集刊》，2023年第6期。
2. Chao Chen, et al., The Gift of Authoritarian Experience: The Determinants of Online Political Efficacy in New Democracies (third author), Telematics and Informatics, Volume 63, October, 2021.
3. 孙亚夫 等：《两岸关系40年历程（1979-2019）》第八章《两岸协商谈判》，北京：九州出版社，2020年。
4. 张遂新 等：《党意、民意与选举——台湾当局“内阁”不稳定原因探析》，《世界经济与政治论坛》，2018年第5期。
5. 张遂新 等：《“主体下行”——中国大陆对台地方交流模式初探》，《台湾研究集刊》，2017年第6期。
（二）两岸社会关系
1. Dongtao Qi, et al., Urban Chinese Support for Armed Unification with Taiwan: Social Status, National Pride, and Understanding of Taiwan (second author), Journal of Contemporary China, Issue 143, Volume 32, 2023.
2. 陈超 等：《社会关系种类、社会关系能力与社会融入——基于在陆台青调查数据的研究》（通讯作者），《闽台关系研究》，2021年第2期。该文获评全国台湾研究会2021-2022年度台湾研究重要学术成果。
3. 王瀚 等：《“好评”会带来“好感”吗?——基于台湾青年的实证研究》（第二作者），《台湾研究集刊》，2018年第4期。
4. 陈超 等：《“实用主义的过客”：台湾青年在大陆社会融入的指标建构与现状评估》（第三作者），《台湾研究集刊》，2018年第1期。该文获评全国台湾研究会2018年对台研究优秀学术论文二等奖，被人大复印报刊资料全文转载。
（三）台湾史/海洋史
1. 张遂新 等：《台湾海峡古环境变迁与南岛语族起源新探》，《人类学学报》，2024年第5期。
2. 刘文静 等：《“三十六岛”观念史：国人对周边海域地理认知变迁管窥》（第二作者），《台湾研究集刊》，2022年第3期。
3. 张遂新：《施肩吾的奇幻漂流——从“施真人”到“民间开发澎湖第一人”的形象建构》，《台湾研究集刊》，2016年第1期。
4. 张羽 等：《两岸青年学生对台湾光复前重要文史议题的集群认知研究》（第二作者），《台湾研究》，2016年第1期。
